A geomorfologia do município de São Joaquim, segundo o Mapa de Geomorfologia do Atlas Geográfico de Santa Catarina (SANTA CATARINA, 2016), é formada por duas unidades da região geomorfológica Planalto das Araucárias: a unidade Planalto dos Campos Gerais, caracterizada por um relevo plano (pouco dissecado), e a unidade Planalto Dissecado Rio Uruguai, caracterizada por encostas em patamares com vales profundos (muito dissecado), sendo a última unidade a que ocupa a maior parte do município (77,63%).

As regiões mais elveadas de São Joaquim estão situadas na porção leste-nordeste do município, nas regiões de Vila Pericó, Cruzeiro, Rondinha, Vila Boava e Despraiado. As altitudes são progressivamente menores na direção oeste.

A geomorfologia de São Joaquim é caracterizada pelas unidades geomorfológicas do Planalto Dissecado Rio Uruguai e Planalto dos Campos Gerais (SANTA CATARINA, 2016). O Planalto Dissecado Rio Uruguai é constituído por um relevo acidentado com encostas dissecadas por vales profundos, enquanto o Planalto dos Campos Gerais é caracterizado por um relevo plano pouco dissecado. De modo geral, o município pode ser caracterizado por altitudes que variam de 715 a 1.638 metros com quase metade de suas encostas com declividade entre 20 – 45 % (do tipo forte ondulado) (SANTOS, 2016; SANTOS et al., 2019).

Os diferentes tipos de rocha que formam a região também conformam os diferentes tipos de relevos observados. As rochas basálticas, com menor teor de sílica possuem também uma menor viscosidade, o que permite a formação de extensos derrames de lavas com superfície plana (Planalto Planalto Dissecado Rio Uruguai). Em contraponto, as rochas dacíticas, por terem maior conteúdo de sílica, e portanto, maior viscosidade, geram derrames menos extensos ou mesmo morfologias mais dômicas (Planalto dos Campos Gerais). As fotos de drone a seguir mostram os dois principais tipos de relevos gerados por diferentes tipos de rocha da região.